Το σύνολο των Πιστωτικών Μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Δ.Μ.Σ. ανέρχονται σε 90.
Για την απόκτηση του Δ.Μ.Σ. απαιτείται η υποχρεωτική παρακολούθηση και επιτυχής εξέταση σε όλα τα μαθήματα τα οποία κατανέμονται στα δύο πρώτα εξάμηνα σπουδών (Α΄ και Β΄). Όλα τα μαθήματα είναι υποχρεωτικά.
Κατά το τρίτο (Γ΄) εξάμηνο των σπουδών απαιτείται η υποχρεωτική εκπόνηση της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας της οποίας οι πιστωτικές μονάδες (ECTS) ορίζονται σε 30.
Το αναλυτικό πρόγραμμα σπουδών διαμορφώνεται ως εξής:
| Α’ Εξάμηνο | ||
| Κωδικός Μαθήματος | Μαθήματα | ECTS |
| Α1 | Bιοϊατρική Επιστήμη: Δεδομένα και Σύγχρονες Ανάγκες | 7 |
| Α2 | Μοντελοποίηση και Αναπαράσταση Βιοϊατρικών Δεδομένων | 6 |
| Α3 | Προγραμματιστικές Τεχνικές Επεξεργασίας και Ανάλυσης Βιοϊατρικών Δεδομένων | 9 |
| Α4 | Ασφάλεια Δεδομένων και Ιδιωτικότητα | 5 |
| Α5 | Ακαδημαϊκές Δεξιότητες | 3 |
| Σύνολο Α’ Εξαμήνου | 30 | |
| Β’ Εξάμηνο | ||
| Κωδικός μαθήματος | Μαθήματα | ECTS |
| B1 | Ανάκτηση και Εξόρυξη Βιοϊατρικής Πληροφορίας από Κείμενα | 5 |
| B2 | Υπολογιστική Ανάλυση Βιομορίων | 7 |
| B3 | Επεξεργασία και Ανάλυση Βιοσημάτων και Εικόνας | 6 |
| B4 | Μηχανική Μάθηση και Τεχνητή Νοημοσύνη | 7 |
| B5 | Ζητήματα Βιοηθικής | 2 |
| B6 | Καινοτομία και Επιχειρηματικότητα | 3 |
| Σύνολο Β’ Εξαμήνου | 30 | |
| Γ’ Εξάμηνο | ||
| Κωδικός μαθήματος | Μαθήματα | ECTS |
| Γ1 | Διπλωματική Εργασία | 30 |
| Σύνολο Γ’ Εξαμήνου | 30 | |
| Γενικό Σύνολο | 90 |